Magis misijos tikslas yra ugdyti ir puoselėti gimnazijos bendruomenės atvirumą pasauliui. Tai taip pat atspindi ir bendrą Bažnyčios poziciją – darbuotis dėl bendro gėrio, vykti į skurdo paliestus kampelius, nešant pagrindinę evangelinio Kristaus žinią: „Eikite į visą pasaulį ir skelbkite Evangeliją“.

„Visiems turime liudyti Jo meilę ir tarnystę, dalintis džiaugsmu!", - įsitikinusi KJG sielovados komanda. Todėl ši misija yra skirta siekiantiems labiau pažinti Dievą bei atrasti jį kasdieniame gyvenime, neįprastoje, iššūkių pilnoje aplinkoje.

Kiekvienais metais vasaros atostogų metu, mokiniai yra kviečiami į Magis misiją. Misija siekia savo veikla prisidėti prie mažų, bet labai svarbių pokyčių pasaulyje, mažinant skurdą ir socialinę atskirtį, o taip pat dalintis tikėjimu su vietos bendruomenėmis, kuriant gražesnį pasaulį.

Per pastaruosius penkerius metus Magis misijose dalyvavo daugiau nei 30 KJG bendruomenės narių. Jie, nors ir kukliai, bet prisidėjo prie kelių mokyklų ugdymo pagerinimo, padėjo mokyklos bendrabučiui Mašuru kaimelyje įsigyti ožkų ir avių, sumontavo saulės jėgainę, prisidėjo prie vandens rezervuarų įrengimo parapijose ir toliau tęsia bendradarbiavimą su bendrakeleiviais misijonieriais Kenijoje.